Trong thời kỳ Ngô Đình Diệm được Mỹ hậu thuẫn đưa về cầm quyền tại miền Nam Việt Nam thì chính sách gia đình trị và thiên vị Thiên Chúa giáo bộc lộ rõ nét. Các tôn giáo có trước Thiên Chúa giáo là mục đích tấn công của Ngô Đình Diệm. Từ năm 1954 đến 1963, Phật giáo là mục đích của chính sách kỳ thị đó. Khủng bố trắng, chụp mũ những người Phật tử trung kiên là Việt cộng. Chính sách kỳ thị rõ nét nhất là chụp mũ làm Việt cộng rồi bắt bớ, chôn sống, bắn giết rồi bỏ bao bố vứt xuống sông phi tang, ai không theo thì bắt giam, gán cho khẩu hiệu là thân Cộng, là Việt cộng v.v... Cao điểm là vụ triệt hạ cờ Phật giáo vào năm 1963.
Phật giáo đồ đã bị xúc phạm, thà chết chứ không chịu khuất phục trước bạo quyền. Tại chùa Từ Đàm Huế, đã nổ ra cuộc biểu tình phản đối chính sách kỳ thị đó. Tại buổi mitting có Tỉnh trưởng Thừa Thiên Nguyễn Văn Đẳng hứa sẽ cho phát thanh lại buổi